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如今医院市场趋于饱和，特别是数量宽大的民营医疗机构。提高医院的效率和效益是其一定的选择，而医院治理系统的建设越来越成为医院生长的重中之重。
医院治理系统作为当下一种先进的医院信息化系统，是治理思路与信息技术相融合的产品，最终目标要实现资源的合理化配置，后勤本钱、设备本钱、人员本钱等。所以在医院治理系统的建设中，本钱核算�？榈拇戳⒆钗匾�，遇到的问题主要可以分为以下四类：
（一）科室设置问题
科室设置即本钱责任中心及本钱核算单位简直定，医院如何分门别类科室？
（二）本钱形态及项目设置问题
本钱按形态可以分为牢固本钱与变换本钱 ；本钱按责任归属可以分为可控的本钱和不可控的本钱。本钱核算时要事先明确是可控的本钱亦或是不可控的本钱。
（三）分摊计划设置问题
如果使用分摊计划的用度需要抵达总用度的 25%，那么需要分摊计划是本钱核算的重要事情内容。
（四）数据来源问题
HRP 的数据来源于医院HIS、LIS、PACS 系统，以及财务系统等，经� ；嵊捎谥种衷蛟斐墒莶畋�，例如无法在 HIS 退费而直接到财务科室治理退费造成的差别 ；学校学生体检收入不入 HIS系统造成的差别 ；社区收入不入 HIS 系统造成的差别等。
在医院治理系统建设历程中，本钱核算是一个必不可少的基础工程，需要投入足够的耐心与精力才华做好。
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